Comme tout logiciel, Joomla! est publié sous différentes versions, appelées "majeures". Chaque version majeure connaît un certain nombre de versions "mineures", elles-mêmes sujettes à des mises à jour.
Pour bénéficier de tous les correctifs de sécurité et des dernières fonctionnalités, votre site doit tourner avec la dernière mise à jour de la dernière version mineure appartenant à la dernière version majeure.
Actuellement, la version majeure est la 3. Les précédentes (Joomla! 1.5, 1.6, 1.7 et 2.5) sont considérées comme obsolètes et ne devraient plus être utilisées. Une version 4 est en préparation et sera publiée en 2018.